Martin Winkler a fait des études de musicologie (chez Winfried Kirsch), de didactique du chant (chez Johannes M. Kösters) et de direction de chœur (chez Helmut Rilling, Hans Michael Beuerle et Uwe Gronostay), puis il a effectué plusieurs cours de perfectionnement auprès de Gardiner, Ericson et Celibidache.

Il a été maître de conférences en direction de chœur au Conservatoire Heidelberg-Mannheim, où il dirigeait la chorale universitaire. Directeur de l’école de musique de Dreieich qui est célèbre dans le domaine de l’enseignement du chant et de la direction, Winkler est à la tête du Collegium de chefs de chœur / d’orchestre, en coopération avec l’Association des Conservatoires Allemands (VdM).

Ses concerts et leurs enregistrements, ses productions pour la radio et la télévision témoignent d’une harmonie profonde dans la collaboration entre Winkler et ses ensembles. Lauréat du Concours d’orchestre allemand ainsi que du Concours de chorale allemand, Winkler a plusieurs fois été honoré sur le plan national et international. De plus, on lui a attribué des prix exceptionnels pour son interprétation d’œuvres contemporaines. Grâce à ces succès, il est très souvent invité en tant que chef de chœur, jury aux concours et maître de conférences lors d’ateliers de direction et de chant choral.

Sur le plan national et international, Martin Winkler est connu pour ses compétences en tant que jury aux concours et chef de chœur qui donne également des cours de chant et de direction.

En 2000 Martin Winkler a été chef de chœur à l’académie germano-polonaise de chant choral « in terra pax ».